內分離主義最嚴重的兩個地區——亞齊省和東帝汶省同時爆發了多宗襲擊當地軍警的嚴重事件。印尼亞齊省是荷蘭統治印尼時,殖民者唯一沒能全部佔領的地區。當地經濟落後但民風彪悍,反抗外來統治者的意志十分堅定。

二戰後,被日本人趕跑的荷蘭人還企圖重新將印尼歸入自己的版圖,1945…1949年新生的印尼共和國和荷蘭殖民者進行了長達四年的獨立戰爭,亞齊是首先完全獨立的地區。因此亞齊人對自己的獨立地位非常自豪。印尼獨立後亞齊雖然自願加入了印尼聯邦,但這些年亞齊內部的獨立意識逐漸抬頭,印尼中央政府只好對該地區採取恩威並舉的措施。一邊宣佈亞齊為高度自治地區,一邊派遣大批軍警進入亞齊,大力鎮壓該地的獨立傾向,而亞齊當地的武裝反抗也愈加激烈,其中最出名的一支獨立派別武裝就是“自由亞齊運動”。

東帝汶的問題則更加複雜,1975年之前東帝汶都是葡萄牙殖民地和託管地,可以說除了和印尼的西帝汶省接壤外,二者間並沒有直接關係。二戰後世界民族獨立運動興起,加上葡萄牙國力衰弱,無暇顧及它在東方的這塊殖民地,東帝汶趁機宣佈獨立,這其中獨立武裝中比較有代表性的是東帝汶獨立**陣線(簡稱革陣)。

1975年11月革陣宣佈獨立,12月印尼就趁機出兵佔領了東帝汶。印尼這種趁火打劫的行為受到國際社會和聯合國的一致譴責,但當時的執政者蘇哈托沉醉在開疆拓土的榮譽中,他又正處在軍事強人執政的頂峰,於是頂住壓力強佔了東帝汶達20年之久。不過甫獨立就又被佔領的東帝汶如何肯低頭,境內的獨立運動此起彼伏,印尼軍方不得不每年佈置大量的部隊在那裡進行軍事管制。

5月12日本來是普拉博沃預定對印尼爪哇島、棉蘭島等處華人聚集區動手的日子,誰料到這天拂曉,亞齊和東帝汶這兩處位於印尼一東一西國家兩端的外島同時傳來發生了襲擊軍警的噩耗。亞齊省比地亞一向是“自由亞齊運動”游擊隊活躍的地區,印尼軍方在這裡常年駐紮著一個營的兵力,這天凌晨,一支進入茂密叢林中巡邏的50多人隊伍突然和營部失去了聯絡,從最後步話機裡傳來的聲音判斷,應該是受到了伏擊。還沒等軍方從震驚中恢復過來派兵支援,營區所在的周圍就響起了密集的槍炮聲。

雖然從槍聲中軍方判斷對方使用了十幾種槍枝,其中不少還是二戰中使用的老古董,明顯是老對手“自由亞齊運動”的游擊隊。對方軍事素質很低,子彈大部分打空,但和往常不同的是,這次槍聲中居然還夾雜著一發發火箭炮一時間竟把印尼正規軍隊壓在營地裡抬不起頭來等軍方組織好反擊火力後,對方一陣哨聲立即撤退的無影無蹤。憋了一肚子火的印尼軍隊衝進密林中搜尋時,只找回失蹤的五十多名軍人的殘骸。最令人生畏的是他們的人頭全部被砍了下來,高高的吊在樹枝上震懾著印尼軍方

遠在印尼西部的東帝汶發生的情況大同小異,當時此地的另一處軍營也在凌晨時分,人的警戒心下降的最厲害的時段裡,熟睡計程車兵被密集的炮火永遠讓他們沉睡了。與“自由亞齊運動”只會用火箭炮騷擾攻擊不同。“革陣”使用大名鼎鼎的63式107毫米火箭炮的水平明顯高了一大截。印尼軍方萬萬沒有想到一向缺槍少彈的“革陣”居然有這種深受世界各國游擊隊都喜愛的面打擊武器,一番火箭炮覆蓋打擊之下,印尼軍方被打的猝不及防,整個軍營一片狼藉。

隨後“革陣”更是利用幾輛裝了14。5毫米機槍的皮卡車在軍營外四下游走,輪番向軍營**擊,印尼軍方居然在長達兩個小時裡無法組織起有效的還擊。等“革陣”呼嘯而去他們事後盤點發現這次死傷慘重,一百多名士兵喪生,一大批軍用物資被摧毀,被外界稱為歷年來印尼軍方和“革陣”武裝交手中損失最慘重的一次。